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１９８９年６月３日，伊朗最高精神領袖霍梅尼在接受消化道出血手術治療２周後，因病情突然惡化病逝，享年８８歲。霍梅尼之子霍梅德４日上午在德黑蘭廣播電臺親自宣讀霍梅尼的死訊。霍梅尼的葬禮在５日舉行。
　　霍梅尼的死訊傳出後，引起不同的反應。伊朗主要反對派回教聖戰組織表示，霍梅尼的去世是其專制政權結束的預兆，聖戰組織領袖拉加維形容霍梅尼是近代最惡名昭彰的獨裁者；伊朗的死對頭伊拉克並未發表評論；而一位熟悉伊朗政策的美國官員則表示，霍梅尼死後，德黑蘭的政策不會有重大改變。
　　霍梅尼是在１９７９年２月返回伊朗，結束１５年的流亡生活，並成為伊朗宗教領袖的。此後伊朗陷入政治鬥爭之中，總統巴尼薩德遭國會罷黜，流亡國外，隨後繼任總統的拉傑又死於爆炸事件中，最後由霍梅尼的親信哈梅內伊當選總統。
　　霍梅尼回國的次年，兩伊戰爭即告爆發，由於雙方不肯讓步，這場戰爭在歷時近８年後才在聯合國的調停下停火，但已造成百萬人傷亡，並殃及許多行駛波斯灣的外國油輪。今年２月，由於英國作家拉什迪撰寫有關回教世界的小說《撒旦詩篇》一書，引起了霍梅尼的不滿，並下達對拉什迪的格殺令，英國與伊朗兩國因而斷交。４月間年邁體衰的霍梅尼下令成立修憲特別委員會，以解決繼任領導人選的問題。霍梅尼病逝後，哈梅內伊被推選為最高精神領袖，但一般預料，以往的集權領導形態可能不復存在。
　　魯霍拉·穆薩維·霍梅尼於1902年出生在德黑蘭附近的霍梅恩鎮的一個宗教世家。他自幼在家鄉古蘭經學校學習。
　　霍梅尼15歲中學畢業，先後到伊斯法罕和阿拉克，拜在當時著名的大學者葉茲德長老門下學習，後來又跟隨葉茲德長老來到庫姆。不久，他也成了一名合格的宗教學者。他寫過25種宗教學術著作和論文，在庫姆執教40年，培養了大批宗教學者，現在伊朗的宗教學者大都是他的學生。50年代末，霍梅尼獲阿亞圖拉稱號，60年代初他又被尊為大阿亞圖拉，成為伊朗伊斯蘭教法權威之一。
　　霍梅尼的政治生涯開始於他在庫姆教書的時期。當時他經常舉辦社會與道德問題的專題講座，由於時常流露出不滿的情緒，引起老巴列維國王的注意。為此，他的講演活動曾遭取締。1941年，他出版了《揭開神秘面紗》一書，揭露了老巴列維國王的獨裁政權。
　　60年代初，霍梅尼因抨擊巴列維國王的“白色革命”，而在政治上嶄露頭角。1963年3月，他在庫姆清真寺演講，要求廢除“暴虐政府”，從而引起了全國性的反政府浪潮。同年6月4日夜，他被秘密逮捕。8月3日霍梅尼出獄後被軟禁在家中。10月，他因發動抵制議會選舉運動再次被捕。1964年11月，他又因發表講話反對國王給美國駐伊朗軍事顧問外交特權而遭綁架，被秘密押送到土耳其。1965年10月，霍梅尼到伊拉克，居住在伊拉克什葉派宗教聖地納傑夫，並通過一所神學院與國內宗教力量保持聯繫，指導國內反君主政權鬥爭。
　　1970年，霍梅尼被伊朗的48位阿亞圖拉擁戴為什葉派領袖。1978年1月，他通過國內的毛拉和市場商人掀起全國性的反巴列維政權浪潮。同年10月，伊拉克政府宣佈霍梅尼為“不受歡迎的人”，他便以旅遊者的身份移居到巴黎，並在那裏建立了伊斯蘭革命委員會，通過向國內派遣人員和遞送其講話錄音帶指揮反巴列維國王政權的鬥爭。巴列維出逃後，霍梅尼於1979年2月1日，衝破巴赫蒂亞爾首相和攝政委員的阻撓回到德黑蘭。2月6日他建立了伊斯蘭共和國，並成為共和國最高領袖和武裝力量總司令。
　　霍梅尼主張政教合一，建立“百分之百”的伊斯蘭國家。他提出“不要東方，不要西方，只要伊斯蘭”的口號，主張輸出伊斯蘭革命。他著有伊斯蘭教神學理論著作20多部。