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台灣出現Ｈ６Ｎ１全球首例人類感染病例，但農委會防檢局指出，對於這位病患是否直接被禽類傳染，防檢局目前持保留態度，須待病毒基因突變檢驗後才能確認。台大醫院兒童感染科主任黃立民強調，這名病患身上培養出Ｈ６Ｎ１病毒，且體內病毒抗體明顯上升，臨床已符合感染個案定義。

疾管局副局長周志浩表示，這名病患五月七日採檢喉頭拭子，之後進行「反轉錄聚合（酉每）鏈式反應測試(ＲＴ－ＰＣＲ)」檢測，僅能得知為Ａ型流感病毒，並未能細部分型，醫院五月廿日通報疾管局後，再次採檢也是相同結果。

後續檢體進一步進行病毒基因定序分析，期間五月廿四日採集病患血清檢體，即使檢體經稀釋廿倍，Ｈ６Ｎ１病毒抗體仍存在；後經二周、六月八日再次採檢血清，經稀釋四十倍後，也仍發現Ｈ６Ｎ１病毒抗體，顯示體內病毒抗體濃度有升高現象。

期間除對採集的呼吸道檢體進行流感病毒檢驗外，也對呼吸道感染常見的病毒例如腺病毒、呼吸道融合病毒、冠狀病毒、腸病毒及鼻病毒等廿三種病毒進行檢測，均呈陰性反應。

黃立民指出，病患體內培養出Ｈ６Ｎ１病毒，且病毒抗體上升，臨床已符合感染定義；周志浩表示，疾管局是在五月卅日完成病毒基因定序，確認是Ｈ６Ｎ１病毒，目前已完成所有檢驗程序。