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台灣H7N9疫苗到底要由誰來研發?除了國光生技外，另一家基亞生技傳出也可望加入生產行列，消息重挫國光股價，還有報紙報導，國光因此拒絕出席衛生署疫苗會議，不過，國光生技董事長詹啟賢出面否認股價、或營收有受到衝擊，強調單純是因為「不想跟不合法的廠商一起開會」，發言非常嗆辣。

巧妙的比喻，國光生技董事長詹啟賢，表達對衛生署有意找基亞生技生產疫苗的不滿，詹啟賢強調，國光是台灣目前唯一符合國際法規的疫苗廠商，但外傳基亞生技由於跟國衛院合作，可能因此納入生產疫苗的委託名單。

4月9日消息傳出，立刻反應在兩家公司股價上，國光雖然一度衝上49.7，之後隨即因喪失獨家生產權而重挫，4月11日甚至跌到42.25，比消息傳出前還低，反觀基亞，4月9日一開盤就從187衝上200漲停鎖死，4月10日開盤甚至小漲到202.5，平面媒体還報導，國光接到許多股東關切電話，才不派員出席會議表達不滿，詹啟賢鄭重否認。

國光生技目前主要生產，日本腦炎疫苗，破傷風疫苗和流感疫苗，但基亞生技主要是作抗癌新藥研發和高階核酸檢驗試劑，自然疫苗的產能也有所不同，國光生技約可達1000萬劑，基亞生技初估只有30萬劑，兩家公司傳出因為競爭產生心結，不過，衛生署卻強調，疫苗委託誰生產根本還沒定案，但畢竟防疫視同作戰，衛生署一定希望在最短時間內，產製最多疫苗防範，兩家並列，甚至加入外國藥廠，都是可能規劃。