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母乳含有多種對抗常見感染疾病的抗體，可以保護寶寶一直到他能自行產生抗體為止，尤以生產後初期幾天所分泌的初乳，更能增加寶寶的抵抗力。
而這些抗體和其它種種的有用抗體，都是以疫球蛋白的形態存誰於產婦體內，會經由血液輸送到乳房，再分泌至乳汁中；所以喝母乳的寶寶，除了對內一般性感染、以及肺部感染抵抗力較強之外，對腸病毒的感染也較具抵抗力，而且母乳中含有種種免疫細胞、細胞素以及生長素等，可以促進寶寶體內的免疫系統的發展以及成熟度。

另外，母乳中所含的「比非得因子」，能讓腸道保持酸性，降低病原體生存的機率。此外，母乳中有利於寶寶免疫系統的功能，會持續到整個授乳期間，甚至在寶寶滿六個月以後，母乳中的免疫功能等相關的因子，仍然會持續的作用，這時要補充的是熱量與部分營養素等副食品。

大多數的寶寶對於母乳較不會過敏，而且容易消化，是寶寶攝取營養的好方式