針對兩岸直航票價過高的爭議，行政院公平交易委員會已經完成調查，公平會副主委施惠芬今（10）日表示，由於華航與長榮違反公平交易法中的限制競爭或妨礙公平競爭之虞，以及足以影響兩岸航空旅客運輸服務市場交易秩序之欺罔及顯失公平行為，因而處華航2000萬元、長榮1200萬元的罰鍰。

針對熱門的兩岸直航票價備受爭議一事，交通部民航局日前表示要對飛航大陸的航空公司進行「道德勸說」，希望調降機票的策略在去年10月也略為奏效，繼華前推出大陸長三角直航萬元有找的國慶促銷票後，復興和長榮航空當時也跟進，其中復興台北、台中的上海直航14天效期最低票價降到新台幣9500元，降幅17%，而且保證機位數至少佔每航班的20%。

此外，兼任黨主席的總統馬英九也在去年10月6日的國民黨中常會上表示，兩岸直航後一票難求，「真正的解決要靠將來增加航班，不過現在幾個熱門的航點，要增班，確實也有困難，所以還是透過交通部，希望業者能夠在業績增加之後回饋消費者」。

馬英九當時還說，行政院長吳敦義在過去這段時間，著力於經濟復甦、疫情防治，以及加強重建工作。另外兩岸直航後，除了一票難求外，票價卻比在香港轉機還高，引發民眾抱怨。馬英九說，最近已經有航空公司願意降低票價，他認為這非常重要，否則大家認為時間少了、距離短了，票價卻更貴，並不合理。

而公平會在著手調查兩岸直航票價過高爭議後，於今日上午鄭重召開記者會宣佈，華航與長榮違反公平交易法中的限制競爭或妨礙公平競爭之虞，以及足以影響兩岸航空旅客運輸服務市場交易秩序之欺罔及顯失公平行為，因而處華航2000萬元、長榮1200萬元的罰鍰。