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　　法蒂瑪哈里發王朝是伊斯蘭教唯一的較大的什葉派王朝，即我國史書所稱「綠衣大食」。909年，什葉派艾卜·阿卜杜拉·侯賽因傳道於北非的柏柏爾人，使叛於在此割據的遜尼派艾格萊卜王朝，逐其末主齊雅德特·阿拉，立波斯人後裔賽儀德·伊本·侯賽因為伊瑪姆。賽儀德(909~934年在位)自稱阿里和法蒂瑪的兒子侯賽因的子孫易司馬儀的後裔。二年後，殺艾卜·阿卜杜拉·侯賽因。其後西並摩洛哥，東侵埃及。約在920年，遷都突尼斯的麥海迪葉。969年，大將昭海爾並埃及，遣其副將進佔大馬士革。在弗斯塔德建新城，973年遷都於此，即開羅。972年建築最大的清真寺愛資哈爾大禮拜寺。其後並麥加和麥地那。  
　　975~996年，法蒂瑪王朝的第五個哈里發艾卜·曼蘇爾·尼薩爾·阿齊茲在位，法蒂瑪帝國極盛。阿齊茲欲圖巴格達，先在開羅置宮殿，準備接待被俘的阿拔斯王朝的哈里發及其眷屬(就像孫皓在江南也準備了宮殿準備俘虜晉武帝居住)。阿齊茲開羅廣修清真寺、宮殿、橋樑、溝渠，寬待國中基督教徒。其王后為俄羅斯人，太子之母，也是亞歷山大港和耶路撒冷兩位基督教主教的姐姐。  
　　996年，阿齊茲去世，子艾卜·阿里·曼蘇爾·哈基木(996~1021年)以十一歲繼位。他在位期間殺大臣，毀聖陵教堂等基督教堂，歧視基督徒和猶太人。其後，哈基木自稱真主化身，一個新教派奉之，即為德魯茲教派，今日此派尚行於黎巴嫩。  
　　1021年，哈基木被暗殺，子扎希爾繼位(1021~1035年)，年十六。與東羅馬皇帝君士坦丁八世約，羅馬皇帝許以東羅馬境內各清真寺中提念哈里發的名字，許重建君士坦丁堡的清真寺，而哈里發許重建聖陵教堂。  
　　1035，麥阿德·穆斯坦綏爾(1035~1094年在位)以十一歲登基，其母為猶太人所賣猶太女奴，與該猶太人攝政。在位六十年，國勢迅速衰落。1043年失敘利亞於塞爾柱突厥。北非西部、西西里島亦失。所可道者，唯1058年，原巴格達將軍白薩西裡強迫阿拔斯朝哈里發嘎義木把職位的各種象徵(包括先知的斗篷和別的遺物)轉到開羅，各地穆斯林開始奉開羅哈里發為正宗。  
　　此後大權落於亞美尼亞軍人白德爾·哲馬利手中。1094年，穆斯坦綏爾死，白德爾之子麥列克·艾弗德勒立其幼子穆斯台阿里。其後宮廷政變頻繁，軍人擅政，幼主頻立；外有基督教十字軍之逼(1167年基督教的耶路撒冷王阿馬利克曾兵臨開羅城下)，且饑疫連年，埃及國勢日窘。1171年，薩拉丁推翻了最後一任哈里發，法蒂瑪王朝亡。