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針對兩岸是否合作研發疫苗，衛生署副署長林奏延9日表示，不會與中國大陸合作研發H7N9疫苗，目前已成立「H7N9疫苗工作小組」，將著手向中國大陸取得病毒株自行生產，或由世界衛生組織（WTO）或美國疾病管制暨預防中心（CDC）提供疫苗株，最快估計2個月內就可生產出第一批疫苗，屆時將優先提供給第一線醫護人員及禽鳥業者。

日前前副總統蕭萬長前往中國大陸參加博鰲論壇，與中國前國務院副總理曾培炎會面時，表達兩岸可攜手開發疫苗的意見，蕭萬長以國光生技生產的疫苗為例，指出我國疫苗獲得美國、聯合國認證，若透過中國提供原料，兩岸可攜手合作開發疫苗。

不過，林奏延表示，我國不會與中國大陸合作研發H7N9疫苗，目前H7N9疫苗工作小組7日舉行第一次會議，本周五將邀集國內疫苗廠與會，詢問廠商研發H7N9疫苗的產能和製程，下周將召開專家諮詢會議，討論未來採購量與接種的優先順序。

目前國內研發H7N9流感疫苗有2種方式，林奏延說，第一種是由中國大陸提供H7N9病毒株，疫苗工作小組會利用反向遺傳法，約4至5周製成疫苗種籽珠，接著進行4至6周的小鼠及雪貂安全測試，確認疫苗珠無致病性，即可提供疫苗廠商生產製造疫苗；第二種方式為，由WTO或美國CDC提供疫苗株，經過國內毒性試驗後，最快2個月內可生產疫苗。

林奏延強調，雖然國內朝向研發H7N9疫苗，不過尚未決定是否量產或提供每位國人施打，預估初期疫苗僅先提供給第一線醫護人員以及禽鳥業者。