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生殖系統發炎感染常合併子宮外孕。北市中醫師公會名譽理事長陳俊明在一場研討會中指出，因感染引發盆腔發炎，子宮外孕的風險增加；急性期主要以清熱解毒藥治療為主；慢性期可搭配改善循環的藥方，具體處方需由醫師診斷後決定。

儘管少見，子宮外孕可能由生殖道結核菌感染而合併發生。婦產科醫師郭文齋日前指出，婦女生殖系統結合菌感染未對症治療，即使受孕，也可能發生子宮外孕。

一些少見的生殖道結核病肇始於骨盆腔內的輸卵管內膜中，而後感染發炎向兩側擴及子宮、卵巢，甚至進一步影響到子宮頸及陰道，所以症狀包括了下腹疼痛、脹痛或月事障礙，也就是骨盆腔發炎的症狀。

這類婦女不少會有不孕問題，這也是較為惱人的合併症，許多案例即使成功懷孕，也會造成流產或外孕問題，所以應儘早就醫、儘早治療，以降低合併症發生機會。醫師詳細的診斷必須將生殖泌尿道的各種感染與腹部脹痛、月經不順或不孕或外孕患者症狀關聯進行釐清。曾有性行為而過去未有經痛者，突然到月經晚期出現非常痛的情形，建議要釐清如子宮外孕等可能性。