若要有效的縮小 Virtual PC 的虛擬硬碟空間，請依照下列步驟進行操作：
在虛擬機器內，清空資源回收桶、刪除 TEMP 暫存空間…等，然後執行作業系統內建的硬碟重組工具程式。
如果虛擬機器所執行的作業系統是 Windows XP 與 Windows Server 2003，建議使用重組功能強又免費的 Disk Defragmenter（下載網址：
http://tinyurl.com/n3pwq），這個功能比起 Windows 內建的 Diskeeper 精簡版強太多了。
在虛擬機器的虛擬光碟，掛載儲存在 <虛擬機器安裝目錄>\Virtual Machine Additions 資料夾（一般來說 <虛擬機器安裝目錄> 是在 C:\Program Files\Microsoft Virtual PC）裡的光碟影像檔 Virtual Disk Precompactor.iso，此時，虛擬光碟應該會自動執行，並載入光碟機中的 Precompact.exe，請按下「是」按鈕來執行 Virtual Disk PreCompactor。這項工作執行完成之後，請按下「確定」按鈕來關閉該程式。
關閉虛擬機器（請不要選擇「Save state」，要選擇「Turn off」）。
開啟 Virtual PC Console，點選「File」功能表，「Virtual Disk Wizard」指令，接著按「Next」按鈕。
選取 ○ Edit an existing virtual disk 核取按鈕，按一下「Next」按鈕。
按下「Browse...」按鈕來指定您所欲壓縮的 VHD 檔，按一下「Next」按鈕。
確認選取了 ○ Compact it 核取按鈕，按一下「Next」按鈕。
依照您的需要選擇「Replacing the original file」（一般都會選這個）或「Saveing the file as:」，按一下「Next」按鈕，依照畫面指示進行操作。
