01、火星城市
遊戲開始後，首先接受安全檢查，接著來到接待台，在那裡領取PDA。去指揮官總部見基地的指揮官，之後跟著小機器人走，它會將你帶到一處倉庫中。隨後你將進入廠區的入口，在這裡獲得手槍及盔甲。穿過黑暗的廠區最終來到壓力艙前，而後由壓力艙進入到室外場景。來到通訊大樓，進入實驗室發現已經來遲，解決了變異的研究員等敵人之後，再次通過壓力艙回到城市中。
02、火星城市地下
通過控制台將中間的設施關閉，然後消滅橋頭躲藏的士兵。沿路前進到一處房間，在房間內的控制台處可找到用於開門的PDA。之後繼續沿路前進，不久會來到另一處房間，而後繞一個大圈子到達路口，在這裡將遇到一些怪物。消滅所有怪物之後，沿路前進會來到安全監控室。這裡的的電腦不僅可以解開鎖上的門，在同一台電腦上還能打開屋外衝鋒鎗的玻璃鎖。最後找到返回的電梯，返回火星城市。
03、火星城市
任務開始後發現這裡也已經被怪物完全入侵，必須得馬上趕到指揮台處。前面的樓梯已經被摧毀，由牆角的鐵梯進入通風管。途中會來到一個房間內，在這裡可以獲得PDA以及開門的權限。使用剛才獲得的PDA打開門，一路殺到醫務室。回到司令部時發現這裡門口已經被封，指揮官自己一人被封在內，只好通過門外的電腦與指揮官對話得知下一個任務目標。得知新任務後一路前進，路過前邊的酒吧後來到一個衛生間。進入之後一個機器人將走過來將領導你走完下面的路。跟著小機器人一路來到電梯前，乘上電梯進入下一關。
04、UAC行政管理區
離開電梯之後，左轉進入Alpha實驗室區，在監控台上找到新的PDA，上面的郵件說到
www.martianbuddy.com上面可以找到關於Alan的詳細信息。穿過上層有殭屍丟鐵桶的屋子後，會遇見奄奄一息的士兵Webb，點擊他身旁大門上的控制板顯示
需要使用William
Banks的PDA通過安檢。回到電梯口的接待處，兩個怪物會打開新的入口，進入裡面的工作間使用電腦，這時巨型的新敵人首次亮相。將敵人幹掉後，出來走右邊的門，穿過走廊在一個小控制台上找到Jonathan的PDA。來到實驗室區上層在一間地上佈置了三顆蠟燭的房間找到William屍體旁的PDA，之後從玻璃走廊出來直接下樓梯，即可到達實驗室大門，此時Webb已經死亡。進入實驗室的大門操作電腦，本關就結束了。
05、Alpha實驗室1區
開始後由電梯出門，在大廳用手電找到控制台的位置，之後馬上過去打開電腦。打開旁邊的大門後，一路向前，會發現前邊的路已經被高壓電和雜物堵塞，而EPD
laser發射間是沒有玻璃的，跳入即可找到新出路。通過控制室旁的控制台可以開啟激光發射器前的鐵閘，沿著激光的方向往裡走可以找到一條維修通道。沿路前進會發現前方沒有路可走，在這裡可以轉向地圖下層通道繼續前進。通過地下通道之後，上樓梯來到本層的控制室。通過這裡沿路前進，拐幾個彎之後會來到一處控制室。從控制室左邊的門進入後將殭屍消滅，並關閉旁邊的電腦後，由旁邊的鐵梯爬到頂層控制室內。與頂層控制室的科學家對話後，使用旁邊的電腦即可解開控制室內右邊的門。最後一路前進到盡頭即可。
06、Alpha實驗室2區
從起始地點出門後，多，沿路前進來到監控室，在這裡可以取得一個PDA。由監控室繼續前進，經過一段很長的通道會來到一處電梯前，乘電梯繼續前進。接著會發現被困的科學家，他將引導你通過後面一段黑暗的區域。通過黑暗的通道後，科學家在出口處犧牲了。順著梯子爬上去，之後再一次鑽進地道，會遇到一些怪物。消滅所有怪物之後，沿路前進到脫離點即可。
07、Alpha實驗室3區
首先解決開始遇到的敵人，之後前進入起重機控制室。在這裡利用控制台上的按鈕控制起重機，將瓦斯桶全丟入角落的坑道中，即可進入下一個房間。在房間內可以找到一個開啟大門的鑰匙卡，之後經過一段通道來到一道門前，用剛才取得的鑰匙卡開啟。通過門後繼續沿路前進，在接下來的一處房間內關閉正在運行的電腦。接下來前進到電梯前，乘坐電梯來到下層。在這裡將會遇到敵人的伏擊，激戰過後前往脫離點，任務就此結束。
08、Alpha實驗室4區
開始會在窗戶旁能看見一名科學家被困於橋上，來到前邊的控制台處，選擇第二項將其釋放。之後繼續前進，剛才那個科學家會在前面迎接你，並且幫你打開一處房門。在房間裡可以找到武器學家Michael
Abrams的PDA，之後繼續前進，在通道裡繞一個圈子後，會來到一處有控制台的地方。在這裡選擇第二項，工作橋將直接連起，敵人隨後也會出現。通過這裡之後，接下來會找到一處梯子。通過梯子爬上主傳送道，然後通過這裡一直前進到達主傳送道的出口。之後房間內會出現大量怪物，將其消滅之後出房間。之後一路前進到地圖最深處，在這裡會遇到怪物蜘蛛女王，將其幹掉任務就完成了。
09、EnPro工廠
這關開始會有一個小機器人與你並肩作戰，之後小機械人會在通道中停止活動。在這裡附近的主控間內聽到有人在求救，進去會遭到怪物的進攻。通過該房間內的電腦解開橋的權限，走到房間不遠處的路口時站到走廊邊緣，橋就會自動伸出。接著來到一個大廳之中，前進到對面會發現一道暫時打不開的門。而後經過通道會找到一處電梯，乘電梯來到下層後經過一間中央有一根光柱的能量儲存室，來到大廳的下層，在此處的控制台內開啟大廳中上鎖的門。之後原路返回大廳，通過剛才打開的門進入通道中。到達通道盡頭，會遇到一個倖存的戰士，他把PDA交給你之後，就被怪物殺死了，最後進入前邊的壓力艙即可過關。
10、通訊中轉站
遊戲開始後，經過一個有機械臂的房間後會遇到密碼門，輸入密碼734即可打開。出來右轉經過一堆桶來到屍體遍佈的房間，這裡會有一名士兵拿出鑰匙卡。消滅掉新出現的怪物後穿過氣閘倉。在樓梯下面找到維修通道，穿過去後來到室外立刻跑向電梯，並由這裡到達上層。在有幾個飛行的露腦怪物的房間裡，先進入左邊拿到PDA，再將右邊的門開啟。經過地面類似岩漿的房間爬上梯子，到達電梯損壞的走廊，右轉在一間屋子裡拿到屍體邊的PDA操作控制板喚來移動平台。跳上平台操縱控制板轉向和行進。向上看準頂層走廊的位置升上去，加速跑跳上去後左轉進入中央控制室。啟動電腦，然後返回乘坐移動平台，這次一直向前然後右轉進入標有「EXIT
LIFT
AREA」的門。在下一道門前地扳會塌落，之後你會發現一件裝備。使用剛才所得的裝備消滅所有的敵人，上樓梯找到黃色的氣閘倉，最後穿過火星地表進入通訊站。
11、通訊站
進入車庫乘電梯到達3層的通訊站，在接待處使用電腦將通訊區解鎖。右轉穿過走廊下樓梯進入通訊中心，拿到Seamus的PDA後回頭走原本關閉的大門。在有兩條變色光管的房間使用牆上的控制台喚出貨梯進入下一層。途經一台連接巨大管道的機器向右經過走廊，找到另一部貨梯，上去後在一道門前可以拿到一個PDA。操作控制台上的電腦放出一個警衛機器人，跟著它一路前進。乘電梯到3層，進入控制中心同帶墨鏡的傢伙聯絡。返回電梯到1層，乘坐開始那部電梯再次進入3層通訊中心大廳，在接待處控制台上察看電腦發現單軌鐵路站已經開啟，按照屋頂的標誌牌進入右邊的鐵路站，最後尋找氣閘倉進入。
12、循環站1區
首先需要前往另一個出口，這需要經過一個工廠區，工廠的入口就在橋斷不遠的地方。進入工廠後，一路前進找到電梯，乘電梯向下進入重工業區。接著會被有毒廢料截斷去路，跳過已損壞的走廊進入到廢料處理主控室。到二樓開啟排放系統，接著爬上控制台旁鐵梯前往廢料處理系統處。
接下來找到控制台，利用控制台停止排放，而後由控制台右邊不遠處的鐵梯爬上去，這樣就可直接回到廢料處理主控室。直接跳到一樓返回剛才被截斷的地方，沿著通道一路前進來到廢料處理廠的出口。之後到達肥料處理廠外層，消滅出現的所有怪物後跳上二層，最後進入前方的密封艙。
13、循環站2區
遊戲開始後進入右手的控制室開啟機器，然後後藉著伸縮鋼柱跳上二樓。前進一段之後會遇到岔口，此時只有一條路可走。沿著通道一路前進，在盡頭處找到樓梯。由樓梯下到管道控制區，接下來會發現一個控制台，使用這個控制台可以排放掉前面一個房間內的全部毒氣。繼續沿通道前進，不久就會來到剛才排放掉毒氣的房間。通過房間後，會來到一個地下室。在這裡幹掉後一個很強的敵人後，前進來到電梯前。接下來會遭遇到瓦斯洩漏，這裡必須快速前往前面三個控制台打開排氣開關。出門後一路走到盡頭，會在一具屍體旁找到一個PDA，由這裡的門出去將進入下一關。
14、單軌鐵路
先在候車椅上找到Sam的PDA，然後進入列車駕駛室，按下上面的選項啟動列車。列車到達第二站後會停下，下列車發現前方的路不允許通行，於是前往主控台將閘門開啟。進門後消滅一群怪物，在大門入口不遠處的屍體旁找到PDA。進入控制台用密碼826打開門，然後再次回到列車上開啟列車。之後會發生撞車事故，下車經過一段很長的路程後來到控制室。在這裡獲得的PDA，接下來用最快的速度衝到下一個控制室，通過這裡之後，沿路走到盡頭就會看到這關的最後一道門。
15、Delta實驗室1區
沿路向前方前進，到達系統控制室時發現缺少Data
Link。繼續前進，途中突然一塊鋼板飛出，從這個洞中可以進入剛才無法進入的區域。進去後繞過前邊的建築物，在後邊建築物門口旁發現科學家的屍體，並找到Data
link。原路回之前的系統控制室，啟動中央控制系統。通過通道以及原本上鎖的門之後，一路可以到達一個大廳。由牆邊亮著紅燈的維修通道繞進去，一路上經過多個電梯後，就會到達反應堆。這裡有一個含有重要資料的PDA在第三層，由一側的門進入即可上去。啟動電源後由大門走出，之後會來到一處檔案館。在這裡會遇到幾個非常難對付的敵人，消滅所有敵人之後，由檔案館的後門進去，繞過一段漆黑的小路，即可回到之前發現Data
Link的地點。最後經由這裡前往系統控制室的路，回到原來無法開啟的電梯處乘電梯。
16、Delta實驗室2a區
來到Delta實驗室2a區後，乘坐右邊的電梯到2層工作間，在一台電腦邊可以找到PDA。穿過走廊進入實驗工作室，找到倖存的工程師McCormick，他說現在空間置換儀器還無法啟動。返回兩側都有大門的走廊，進入前面有箱子的門可以到達一個有機械臂的房間。利用對面牆壁上有帶編號的箱子跳上去，就可以進入右側牆壁上的通道。進入控制室，使用電腦開啟旁邊的門，然後在中央控制台上啟動置換儀器。從另一道門出去就是走廊，現在進入對面的門，搜索裡面每一個房間，在最裡面的SERVER間的一個機器上拿到等離子導管。回到McCormick所在的工作間同他交談，通過裡面的掃瞄倉就可以來到傳送裝置前，站到上面使用控制面板就可以傳送至下一個區域。
17、Delta實驗室2b區
來到Delta實驗室2b區之後，發現這裡其實就是剛剛使用的傳送裝置的對面。走廊左側的門需要鑰匙卡才能打開，卡在前面觀察室內的殭屍身旁。通過之後，跟隨一個怪物找到電梯，上2樓爬入一個冒黃色煙霧的小通道，進入解剖室。在這裡會遇見Michaels博士，讓他繼續工作。穿過走廊，將屋裡的怪物全部消滅，原本關閉的門就會開啟。進入標本室，先從右側的門來到控制台前啟動培養皿軌道，跟隨移動的標本找到盡頭的門。之後繼續跟隨培養皿走，可以在前面的一間屋子裡找到電梯，通過電梯來到上層。經過後面的走廊來到一個工作間內，在這裡可以找到PDA，最後前往3層找到一道門，輸入密碼463，這關就隨之結束了。
18、Delta實驗室3區
開始進入旁邊的控制間B，在那裡開啟後面的門。之後沿路前進，途中會經過一個控制間，進去打開通往傳送室的門。出來後繼續沿通道前進，在通道盡頭會發現一個傳送台，將傳送位置設置為PAD2樓。完成傳送後沿通道前進，途中會發現
一個控制台，利用其開啟通往下一傳送站的門。在通道盡頭找到維修通道，而後由那裡前往第二傳送站，選擇PDA3即可被傳送到一間倉庫內。從倉庫出來，沿著通道前進到一個岔口。向左前進會發現一個控制台，打開大門然後從岔路另一側前進。找到傳送台後，選擇位置PDA1，最後進入電梯。
19、Delta實驗室4區
任務緊接上一關展開，首先沿著滿地血跡的道路一直向前。之後會發現博士已經打開了連接基地和地獄的傳送門，幹掉兩個怪物後，進入傳送門。
20、地獄
在地獄中唯一的目標就是找到soul
cube，這關基本沒有什麼難點，只要消滅所有遇到的敵人，就可以一路向前。最後會被傳送到競技場，在這裡會遇到一個巨大的牛頭怪，只要看準機會攻擊其背後的藍色光球，就可以很快取得勝利並得到soul
cube。最後原路返回這關的起點，利用傳送裝置返回。
21、Delta實驗室5區
從地獄回來之後，身上除了神器之外什麼也不會留下。遊戲開始後，首先從起始點前方不遠的地下通道鑽到傳送大廳外。出去後一路前進，由電梯間內應急樓梯爬到頂，而後從通風管進入基地上層。沿路前進，拐幾個彎後，會在途中遇到兩隻強力的怪物。消滅掉他們之後，一路通過數個電梯後，就會來到基地的深處。在大廳處那個垂死的人身旁獲得PDA，隨後通過維修通道繼續前進，緊接著是一場激戰。隨後在大廳角落裡找到開啟旁邊大門的PDA，開門之後一路前進到盡頭即可找到傳送站，這個任務到此結束。
22、中央處理站
穿過走廊左邊的屋子出去，接著遇到岔路。先向右跳過懸浮的石板進入有大屏幕的房間，在裡面牆壁上的洞口內能找到Tony的PDA，使用大屏幕下面的電腦，可以得到一組密碼627，而後使用屋內的電腦啟動系統。返回岔路口，左轉在盡頭的門上輸入627。進入裡面後一路向前，之後會進入計算機房。乘電梯上樓，接著找到2-3層的電梯，而後再向上繞過帶刺的地板，在裡面的儲物室中找到Dlib交換板。回到起點，找到標有向下箭頭的門，進去找到通往1-B的電梯。最後進入地下室，穿過走廊，就可以看到通向下一個區域的門了。
23、中央服務器陣列
遊戲開始後，首先進入中央服務器陣列室。將所有怪物全都消滅之後，通過測驗進入中央那扇緊閉的門。接著會來到巨大的圓形空間，按動左邊的面板會出現一條道路，選擇屏幕上對應顏色的按鈕可以到達要去的地方。選擇前往藍色的服務器陣列(SERVER
BANK)，在下層的工作間平台上取得Steve Tooloose的PDA。返回中轉裝置選擇紅色的中央處理站(CENTRAL
PROCESSING)，在這裡會遇見生化士兵。之後從入口對面的小倉庫左邊的維修通道進入，順著管道即可找到電梯。
24、3號
該任務中，在一個佈滿石板的房間可以找到一個小控制室，在那裡可以見到Rogers博士。拿起他放在桌子上的PDA，然後返回起始地點。通過儲藏室左邊原本無法大開的門，乘電梯到2層，穿過一段走廊後右轉上樓梯。在盡頭的控制室使用電腦啟動貨物裝載機，而後返回不遠處的樓梯。從坍掉的地方爬梯子下去，接著通過一段通道就能夠回到入口處。進入儲藏室，乘坐黃色的載貨車來到電梯間，最後乘電梯進入洞穴。
25、洞穴1區
首先上樓梯並穿過幾道門，而後通過走廊向左前進，就可以來到洞穴外部。接著在控制室外面按下按鈕將梯子放出，爬上梯子跳到對面的鐵架台上，而後由窗口進入旁邊的控制室。在控制室內找到控制台，按下控制台上的連線按鈕。乘貨梯到下一層，出門前往平台使用控制面板將電梯升上來，乘大電梯深入地心。來到對面一處控制台前，使用控制面板降下梯子。爬上去後找到電梯，而後乘電梯前往2層，出來後再爬上外側較高的梯子到達頂層平台。進門後連續爬下幾個梯子，借助這些板子做緩衝，穿過風扇到達底層。在管道背後的角落找到Katayama，拿走旁邊的鑰匙卡。回到風扇下面，啟動兩個管道中間的控制面板將梯子升起來，爬回到控制室2層用鑰匙卡開啟那道鎖著的門。在裡面的桌子上拿到Robert的PDA，接下來通過走廊來到一處門前，開啟大門來到工程區，爬上吊車將吊臂調整到右轉105度，並將貨物拉到最遠處。之後從駕駛室邊的梯子爬到吊車頂部，通過一系列跳躍安全的到達對面。找到電梯前往下面一層，出來後右轉前進，就會來到洞穴外面，最後找到電梯即可。
26、洞穴2區
任務接著上一關展開，先穿過洞穴通道，而後可以找到一張鑰匙卡。進入挖掘基地，穿過一個大廳之後，會遇到蜘蛛女王。將其消滅之後上樓，然後找一道刻有神秘文字的門。進入那道門，發現裡面的能源已經被切斷。啟動電梯旁邊的臨時電機恢復供電，之後乘電梯進入底層，最後一個任務就隨之開始了。
27、主挖掘點
這關開始沒有任何迷題，一路前進來到通道盡頭，就會遇到巨大的最終BOSS——牛頭巨人。一般的武器對它造不成任何傷害，因此只能利用SoulCube來對付它。每殺死五個敵人就可以使用一次SoulCube，對其攻擊五次即可取得最後勝利。
